新管区は、エルサレムおよび中東聖公会にあった、北アフリカおよびアフリカの角を含むエジプト教区で成り立っています。
２日 〔聖霊降臨後第９主日〕〕日本聖公会代祷表２０２０年８月
アレキサンドリア管区、ムーニア・ハンナ・アニス大主教のため
エジプトは、イエスの誕生直後、ヘロデから逃れるための滞在地となった。
キリスト教の宣教は伝道者聖マルコによって伝えられたとされる。聖公会の宣教は 1819年、コプト総主教の祝福を受けてCMSの宣教師がアラビア語で福音書を配布したことに始まった。
エジプトの最初の聖公会の教会は1839年にアレクサンドリアの聖マルコ教会が建てられた。
1976年にエジプト教区はエルサレムおよび中東聖公会の一部となった。
近年ではエチオピアのガンベラ地域などで持続的な成長が続いている。
2020年6月、エジプト教区はエルサレムおよび中東聖公会から独立し、聖公会の第41番目の管区となった。